| 系等 | 講座 | 分野 |
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生化学 | 分子生物学 ｜ 医化学 |
| 解剖学 | 解剖発生学 ｜ 組織細胞学 | |
| 生理学 | 時間生理学 ｜ 認知行動学 | |
| 薬理学 | 神経薬理学 ｜ 細胞薬理学 |
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病理学 | 分子病理学 ｜ 分子細胞病理学（病態医科学，腫瘍病理学） 分子診断病理学(協力分野) |
| 微生物学 | 免疫学 ｜ 病原微生物学 |
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予防医学 | 環境医学 ｜ 公衆衛生学 ｜ 国際保健医学 |
| 社会医療管理学 | 法医学 ｜ 医療統計・医療システム学 |
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内科学 | 呼吸器内科学 ｜ 免疫・代謝内科学 ｜ 消化器内科学 循環病態内科学 ｜ 腫瘍内科学 ｜ 血液内科学 健康管理医学(協力分野) |
| 病態情報学 | 放射線医学 ｜ 核医学 ｜ 放射線生物学（協力分野） 放射線医学総合研究（連携分野） |
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外科学 | 消化器外科学 I ｜ 消化器外科学 II ｜ 循環器・呼吸器外科学 腎泌尿器外科学 |
| 侵襲制御医学 | 麻酔・周術期医学 ｜ 救急医学 |
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機能再生医学 | 整形外科学 ｜ 運動機能再建医学 ｜ 形成外科学 体幹支持再建医学 ｜ リハビリテーション医学(協力分野) |
| 生殖・発達医学 | 小児科学 ｜ 産科・生殖医学 ｜ 生殖内分泌・腫瘍学 | |
| 感覚器病学 | 皮膚科学 ｜ 耳鼻咽喉科・頭頸部外科学 ｜ 眼科学 | |
| 神経病態学 | 精神医学 ｜ 脳神経外科学 ｜ 神経内科学 |
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先端医学 | 神経生物学 ｜ 臨床統計学 ｜ 人類進化学 トレーサー情報分析学（協力分野） ｜ 医学物理工学（協力分野） 分子追跡医学（協力分野） ｜ 細胞機能学（協力分野） 先進医療マネジメント学（協力分野） |
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免疫科学 | 感染病態学(遺制研) ｜ 免疫生物学(遺制研) 免疫制御学(遺制研) ｜ 分子免疫学(遺制研) |
| 癌病態学 | 癌生物学(遺制研) ｜ 癌ウイルス学(遺制研) 癌関連遺伝子学(遺制研) |
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分子イメージング |
| 時間医学 | |
| 人工関節・再生医学 | |
| 分子制御外科学 | |
| 炎症眼科学 | |
| 総合女性医療システム学 | |
| 探索病理学 | |
| 脊椎・脊髄先端医学 | |
| 眼循環代謝学 | |
| 移植外科学 | |
| がん予防内科学 |
| 附属動物実験施設 | 連携研究センター |
| 医学教育推進センター | 国際連携室 |
| 広報室 | 医歯学総合研究棟中央研究部門 |
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